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3e journée du réseau thématique transversal « Interactions Micro-organismes Hôtes »

Amphithéatre du CNRS, route de Mende, Montpellier - Lundi 21 novembre 2011

Séquençage à haut débit et bio-informatique appliqués aux Interactions Micro-organismes-Hôtes

L'entrée est libre sans nécessité d'inscription.

Programme :
 

9h00-9h15 : Introduction de la journée

Session I : SEQUENÇAGE DE NOVO ET COMPARAISON GENOMIQUE

9h15-10h15 : Megaviridae: the emerging paradox of quasi-autonomous viruses, Jean-Michel  Claverie, Information génomique et structurale - CNRS UPR2589, Marseille

10h15-10h45 Pause Café

10h45-11h15: Caractérisation du génome flexible des bactéries entomopathogènes Photorhabdus et

Xenorhabdus pour l’identification de nouveaux facteurs d'adaptation à ses hôtes invertébrés, Jean-Claude Ogier, UMR Dgimi, Montpellier

11h15-11h45 : Génomique comparative et évolutive du champignon phytopathogène Magnaporthe oryzae, Elisabeth Fournier, UMR BGPI, Montpellier

Session II : TRANSCRIPTOMIQUE (1)

11h45-12h15 : Titre à venir, Stéphane Bellafiore, RPB, Montpellier.

Repas (non assuré par le réseau)

Session II : TRANSCRIPTOMIQUE (2)

14h00-14h30 : Identification de signatures d'expression de gènes associées à une réponse immunitaire efficace de l'huître Crassostrea gigas à des Vibrios pathogènes par des analyses DGE (Digital Gene Expression), Julien De Lorgeril, UMR Ecosym, Montpellier.

14h30-15h00 : The immune response of Pocillopora damicornis confronted to Vibrio coralliilyticus: a RNAseq approach, Jérémie Vidal Dupiol, UMR  Centre de biologie et écologie tropicale et

méditerranéenne, Perpignan

15h00-15h30 Pause Café

Session III : BIOINFORMATIQUE

15h30-16h30 : An integrated approach for analyzing RNA-seq reads with a reference genome , Nicolas Philippe, Lirmm, Montpellier

16h30-17h00 : MicroRNAs role in plant-bacteria interactions in cassava and rice: bioinformatic and genomic approaches, Alvaro Pérez, Universidad Nacional de Colombia

17h00-17h30 : Présentation de la plateforme bio-informatique LIPM/SPE-Inra, Jérome Gouzy, Toulouse

17h30-18h00 Discussion - Conclusion

comité d’animation scientifique

boris.szurek@mpl.ird.fr

david.ocallaghan@univ-montp1.fr

Delphine.Destoumieux-Garzon@univ-montp2.fr

ogliastr@supagro.inra.fr

sgaudriault@univ-montp2.fr

Date de création : 11/10/2011
Date de dernière mise à jour : 21/10/2011